Dans une enquête menée en 2012, Edouard Perrin a révélé l’existence d’accords secrets entre l’administration fiscale luxembourgeoise et des multinationales, qui permettaient aux entreprises de réduire considérablement leurs impôts. En coopération avec le Consortium international des journalistes d’investigation (ICIJ), son enquête a débouché sur le scandale Luxleaks en 2014. Il a reçu de multiples récompenses pour ses révélations. Il a également été inculpé pénalement par le Luxembourg et a été acquitté à deux reprises.

Il a été Knight-Wallace Fellow à l’université du Michigan (2016). Il a reçu le prix du « Journaliste de l’année » lors des Assises du journalisme de l’année 2016 en France et figurait sur la liste 2016 de Politico Europe.

Il a été le premier président du conseil d’administration de Forbidden Stories et en a été le secrétaire général. Il est membre du comité du réseau international de l’ICIJ. Depuis 10 ans, il est membre du jury du prix Bayeux des correspondants de guerre. Depuis 2022, Edouard Perrin enseigne le journalisme collaboratif au sein du novateur « Crossborder Journalism Campus ».